分析它们之间的关系，要有精神哲学（包括认识论）和社会哲学的视野。
1、三者的含义（区别）
①一般说来，思想是指思维即理性认识的结果。思想往往具有体系性，是思想体系的简称。
参见《现代汉语词典》的释义：
思想（1）客观存在反映在人的意识中经过思维活动而产生的结果。思想的内容为社会制度的性质和人们的物质生活条件所决定，在阶级社会中，思想具有明显的阶级性。（2）念头；想法：她早有去农村参加农业生产的～。（3）思量。
②常见用法，主义是指影响广泛的理性认识。例如，马克思主义、列宁主义、弗洛伊德主义。
参见《现代汉语词典》的释义：
主义（1）对客观世界、社会生活以及学术问题等所持有的系统的理论和主张：马克思列宁～｜达尔文～｜现实～｜浪漫～。（2）思想作风：本位～｜自由～｜主观～。（3）一定的社会制度；政治经济体系：社会～｜资本～。
③作为名词，理论是指系统化的理性认识。
参见《现代汉语词典》的释义：
理论（1）人们由实践概括出来的关于自然界和社会的知识的有系统的结论。（2）辩论是非；争论；讲理①（多见于早期白话）。（3）理会②（多见于早期白话）。
2、三者的联系
①主义是具有特定内容、影响广泛的思想体系，其理论性质有真理和谬误之分。
②不同时代的人们创立的主义、思想和理论可能具有一脉相承的精神联系。
科学发展观，是同马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想既一脉相承又与时俱进的科学理论，是马克思主义关于发展的世界观和方法论的集中体现，是马克思主义中国化最新成果，是中国***产党集体智慧的结晶，是发展中国特色社会主义必须坚持和贯彻的指导思想。——中国***产党章程（中国***产党第十八次全国代表大会部分修改，2012年11月14日通过。《人民日报》（2012年11月19日01版）