司令员是军队高级建制单位的军事主官。
在我军，司令和司令员没什么区别，不过司令员是正式称谓。军、兵种、武警总部、大军区、省军区、军分区、卫戍区、警备区、海军舰队、军区空军和各基地的军事主官称作司令员。
2012年（壬辰年）10月28日各省武警总队总队长统一改称为：司令员。
其它国家军队没有司令员的叫法，一般都称呼司令。
司令员是规范的称呼；司令是口语，不规范，特别是在行文或著书时不应使用“司令”。但两种叫法的都是指某部队的最高军事指挥官。
司令的起源：
中国古代就有“司令”之官。但和现在的司令风马牛不相及，不是军队的高级指挥官，而多为掌管宫廷某项事务的一种职官。
隋朝设有司令一职，为内官。据《北史·后妃传序》载：“司令三人，掌图籍法式，纠察宣奏。”金朝时司令为典卫司、宫苑司、惠民司等机构的长官，主管本局、司事务，品秩为从六品至正七品。