为什么曾经辉煌一时的古滇国会突然间消失匿迹，其实到了现在都没有一种具体的说法。第1种说法，古滇国是毁灭于自然的灾害。有人就认为古滇国之所以没有任何历史遗留下来的证据，只是在一些古代文献中存在着片言只语的记录，可能是国家遭遇到自然灾害比较突然而且大型，来不及反应整个国家就毁灭了，而现代的一些考古专家就在湖底下发现了古滇国的一些遗迹，由此推断，那时候的古滇国可能遭受了类似海啸以及强烈的地壳运动这样的自然灾害，导致整个国家下沉而遭到了海水的淹没。
但是后面随着考古学家的发现也推翻了这一个说法，因为如果古滇国曾经遭遇过如此大型的自然灾害，那么在一些其它朝代中的文献必定会有所记录，但是考古学家却没有发现一点相关的记录。第2种说法，古滇国并没有消失只是被同化，古滇国在历史中存在的时间大概有100年左右，在春秋战国时期，其实当时的楚国就曾经打过古滇国的主意，想要吞并它，但是计划还没实施成功就被秦朝给灭了。之后秦朝统一六国，但是这个时候古滇国还是一个独立的王国，短暂的秦朝统治并没有时间去顾及古滇国，直到汉朝。
古滇国这个土地肥沃的地方就进入到汉代统治者的眼中，当时的汉武帝于是就出兵攻打古滇国，在汉朝强大的武力面前，古滇国的国君只能屈服而当时的古滇国统治的地域也被改为了益州郡。正是因为汉潮的扩张而导致了古滇国被同化，渐渐的融入了中原的文化当中，而自身的文化也慢慢的退出了历史的舞台，所以并没有大量的记录。
第3种说法消失于战争。由于当时富庶的古滇国，被汉朝给盯上了，而在汉朝侵略的过程中，给予古滇国国家甚至其文化毁灭性的打击，导致了大部分古滇国人员的死亡，最重要的是相关记录文献的毁坏，以至于在后世没有过多的记录。