本条目介绍一下全球免费让公众使用的化合物及药物分子数据库，对化学及药物研究特别有用。
（注意：以下信息来自于美国MedKooBiosciences，Inc。）
1.美国国家医学图书馆化学身份证（CHEMIDPLUS）数据库
该网页可检索药物化学结构，本网站可以用药物名称查找其化学结构.此外,本数据库还可以查看毒性,理化性质,药品代码等。
2.美国国家医学图书馆PUBCHEM数据库可检索药物化学结构
本数据库是美国国家健康研究所（NIH）和美国国家医学图书馆（NLM)的大型药物分子库。NIH是美国医学研究机构，下设27个机构和中心，也是美国健康与人类服务部的一个组成部分。它是一个重要的联邦机构，执行和支持基础、临床及可转化医学研究，调查普通及罕见疾病的原因、治疗及治愈情况。PubChem数据库是美国国家卫生署分子库路线图计划的一个组成部分，是由NIH国家生物技术信心中心开发的一个化学结构及分子生物活性综合数据库.
3。美国国家癌症研究所（NCI）抗癌药药物词典
该数据收集了4000多条与癌症医学相关的术语和化合物性质。
4.药物合成数据库（Drug）
该数据是这个药物在线网推出的数据库.本数据库提供近7000种已上市或在研药物的药物合成相关的信息，如药品名、结构式、化学名、CAS登记号、分子式、分子量、化学活性、开发阶段、研究机构等。最大的优点是快速检索合成路线，并给出参考文献来源。
检索条件支持模糊查询，各输入条件间的检索关系为逻辑与（即AND关系）。检索条件选择其一即可查询。检索方法包括：
*药物名称：（注：包含通用名、商标名、研发代号、异名等）。如Loratadine、Cefpirome.
*化学名称：（注：包含CA命名、普通命名等）。
*CAS登记号：（注：美国化学文摘登记号）。
5.有机合成方法数据库
Since1921,hasprovidedthechemistrycommunitywithannualcollectionsofdetailed,reliable,andcarefullycheckedproceresforthesynthesisoforganiccompounds.Someproceresdescribepracticalmethodsforofspecificcompoundsofinterest,whileotherimportantsyntheticmethodswithgeneralutility.Eachprocereiswritteninmoredetailascomparedtotypicalinotherjournals,andeachreactionandalldatahasbeencarefullycheckedforinthelaboratoryofamemberoftheBoardofEditors.
Organicmaybeaessedeitherviathetablesofcontentsof(journalmode)orbyconctingstructureand(databasemode).Specificindivialprocerescanbeaessedviathetableofcontentsforeithertheoriginalannualvolumevolumeinwhichtheprocereappeared.DatabasemodeallowsuserstosearchallvolumesofOrganicSynthesesbykeywordsorbyinputtingstructuresand.StructuretheChemDrawpluginwhichcanbedownloadedaordingtofoundintheleftmargin.ArticlesfromfuturevolumesofOrganicSynthesesthatarenotyetincorporatedinthesearchabledatabasecanbeaessedontheOrgSynExpresspage.
6.有机合成人名反应
该数据库是药物在线网推出的数据库.TheOrganicNameReactions(ONR)sectionisintendedtoservetheprofessionalchemistandstudentbydescribingorganicchemicalreactionswhichhavecometoberecognizedandreferredtobynamewithinthechemistrycommunity.Aselectgrouphasbeenchosenforadditiontothissection.Eachreactiondescriptionisdesignedtobeinformativeandrepresentativeofthepertinentliterature;however,itisnotmeanttobecomprehensive.Thedescriptionsarecomposedofthefollowing:(1)name(s)associatedwiththereaction,(2)theoriginaland/orprimarycontributor(s)connectedwiththediscoveryand/ordevelopmentofthereaction,(3)aconcisedescriptionofthetransformation,(4)areactionscheme,(5)keyreferences,and(6)crossreferencestootherONRbasedoncommonalities.Theindexincludedinthissectionalsolistssupplementaryterms.
7.有机合成反应库
该数据可是这个药物在线网推出的数据库.含有400多个有机合成人名反应。
8.化学物质索引数据库（ChemicalIndexDatabase）
该数据库是药物在线网推出的数据库。本数据库为化学物质特性数据库，包含大量具药理活性及生物活性的物质性质信息数据。检索条件支持模糊查询，各输入条件间的检索关系为逻辑与（即AND关系）。化学结构式为矢量格式图片，可利用系统自带图片预览工具或支持该格式的工具进行无损缩放查看。检索结果包括：（a)索引信息：如物质名称、化学结构式图、化学文摘登记号(CAS)、CA名称、商标名、化学结构式、分子式、分子量、元素组成等。(b)参考文献：提供公开物质理化性质、制备方法、分析方法、药理药效、临床研究等的重要期刊、专利、综述等极具参考价值的文献。(c)物质特性：包括理化特性数据，如熔点、沸点、闪点、溶解性、多晶物质状态、光谱吸收特征数据、药物治疗分类等.
其检索的方法有：
*物质名称(英文名)：（包含化学名、通用名、商标名、异名等的全名或部分(大于3个字符)，如Ceftriaxone,Adefovir.）
*CA登记号(CASRegistryNumber)：
*注:美国化学文摘登记号
*参考文献(LiteratureReferences)
*药理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治疗分类(TherapeuticCategory)
*分子式(MolecularFormula)
*分子量(MolecularWeight)
*熔点(MeltingPoint)
*注:熔点值,以摄氏度为单位
*沸点(BoilingPoint)
*注:沸点值,以摄氏度为单位
*解离常数(pKa)
*比旋度(OpticalRotation)
*油水分配系数(LogP)
*最大吸收值(AbsorptionMaximum)
*密度(Density)
*折光率(IndexofRefraction)
*毒性数据(Toxicity)