1. 孔志明，杨柳燕，尹大强，程树培. 现代环境生物学实验技术与方法. 中国环境科学出版社，2005.12
2. 杨柳燕著. 有机粘土和微生物联合处理有机污染物的机理与应用研究. 中国环境科学出版社，2004.5
3. 秦伯强等编著，杨柳燕参编. 太湖水环境演化过程与机理. 科学出版社 2004.2
4. 肖琳，杨柳燕，尹大强，张敏跃编. 环境微生物实验技术. 中国环境科学出版社，2004.6
5. 杨柳燕，肖琳主编. 环境微生物技术. 科学出版社 2003
6. 王连生主编，杨柳燕编委. 环境科学词典. 化工出版社，2002
7. 孔繁翔主编，杨柳燕参编. 环境生物学. 高等教育出版社，2000
8. 马文漪，杨柳燕主编. 环境微生物工程. 南京大学出版社, 1998
9. 杨柳燕等译. 环境管理中的市场与政府失效：湿地与森林. 中国环境科学出版社,1996
10. 程树培主编，杨柳燕参编. 环境生物技术实验指南. 南京大学出版社，1995
11. 程树培主编，杨柳燕参编. 环境生物技术. 南京大学出版社，1994