玄奘法师亲自自撰的不多，“梵文写的《会宗论》三千颂，《制恶见论》一千六百颂而外，还应东印度童子王的请求，造了《三身论》三百颂，但这些都没有译成汉文，因而也未流传后世。”，应太宗的要求而修撰《大唐西域记》十二卷，还是口授辩机写成的。
另外，向当时朝廷陈事的表启，现存一卷。至于有关学说，则大都为其门下各家所记的口义，特别是见于圆测一系新罗学人著述上的占多数。通称为法师自作的有《三类境》一颂，载《成唯识论掌中枢要》卷二内，又有〈赞弥勒四礼文〉，载《法苑珠林》卷十六，另传法师论‘五种不翻’，周敦义〈翻译名义集序〉曾见称引。至后人所传的《八识规矩颂》，文义都有可疑之处，并非他的手笔。
至于大多认为是他著述的《成唯识论》其实是在其弟子窥基法师的建议下，糅印度解释唯识十家之说而辑译为《成唯识》一论。不能算他的著述。