真菌分类系统屡有变动，国内植物病理学界长期采用Ainsworth(1971)系统，将真菌界真菌门划分为鞭毛菌亚门接合菌亚门子囊菌亚门担子菌亚门和半知菌亚门由于分类系统的变动，此种广义的“真菌”已不复存在根据《真菌词典》第8版(1995)第9版(2001)和第10版(2008)，原来属于鞭毛菌的根肿菌卵菌丝壶菌等已归入其他生物类群，真菌界现包含子囊菌门担子菌门球囊菌门和壶菌门，半知菌不再作为分类单元
真菌分类系统屡有变动，国内植物病理学界长期采用Ainsworth(1971)系统，将真菌界真菌门划分为鞭毛菌亚门接合菌亚门子囊菌亚门担子菌亚门和半知菌亚门由于分类系统的变动，此种广义的“真菌”已不复存在根据《真菌词典》第8版(1995)第9版(2001)和第10版(2008)，原来属于鞭毛菌的根肿菌卵菌丝壶菌等已归入其他生物类群，真菌界现包含子囊菌门担子菌门球囊菌门和壶菌门，半知菌不再作为分类单元