两岸mou的作用如下：
1、反应出两岸往来以经济为优先，政治其後的务实态度。这也为未来两岸经济合作协议（ECFA）协商奠下基础。 MOU签署，也会为台湾股市带来中国合格境内机构投资者（QDII）的投资活水。
2、两岸MOU协议签署将有利于中国和台湾的金融发展和交流，促进两地发展。从中国大陆和中国香港签订CEPA之後，很好地促进两地经济金融合作和发展就是一个很好的例子。
3、尤其重要是，有别于香港，台湾有着大量高科技制造业.MOU协议签订，将更能通过金融手段促进两岸经贸往来和直接投资。
4、国台办新闻发言人杨毅指出：两岸银行、证券及期货、保险业监管合作备忘录的签署，标志着两岸金融监管机构将据此建立监管合作机制。
5、预示着两岸金融合作将进入实质阶段，有利于促进两岸金融业的优势互补和***同发展，有利于进一步优化大陆台资企业的融资环境，在两岸金融合作历程上具有重要意义。
面临问题
两岸签署MOU，接下来重头戏是金融市场准入，两岸金融机构蓄势待发，已登陆设办事处的八家台资银行取得先机；而大陆方面，中国银行多次表态舍我其谁的登台决心，最为积极。
中行行长李礼辉在九月间，率团访台，更在与兆丰银行会谈时表示：“希望人民币清算银行的对口单位是兆丰。”强调不仅要来台设点，也以中行在大陆每个城市都有据点、全体员工二十五万人为后盾，要帮忙兆丰银行找行舍、设点。