答案是肯定的。特别赞你的问题限定，在这个限定下，五笔输入的准确率高于拼音是显然的。(问题补充里的其他东西，建议另开问题)
下面说理由：
1. 起跑线
如果一个人从没学过五笔，也没学过拼音，那他很容易学会五笔，却很难学会拼音。
（实例很多，我身边不会拼音的长辈有的用五笔打字，有的用笔划打字，但是没有学会用拼音的，因为拼音太难了）
之所以提这点，是因为严格来讲，学习五笔和学习拼音的起跑线不同，在完全同一条件下比较两者的准确率是不可能的。
五笔输入法初学者，大部分是从零开始学一门输入法
拼音输入法初学者，大部分是根据幼儿园+小学N年的拼音经验学输入法
很多人觉得五笔比拼音难，是因为他们忽略了自己学拼音花的代价，用几年时间学拼音，用若干天学五笔，如何能相提并论？
（之所以不提认字，是因为在比较准确率的目标下，认字对五笔和拼音来说都是必须的）
2. 初学者困扰
放宽条件，暂且认为五笔初学者和拼音初学者在起跑线上是等同的，五笔初学者学会了拆字根，拼音初学者学会了拼拼音，再比较：
五笔初学者遇到的最大困扰是打不出某字，而不是打不对某字。拼音初学者遇到的最大困扰是打不对某字，而不是打不出某字。这样，拼音初学者打错的概率远高于五笔。
五笔初学者打难拆字时要想一阵儿，甚至根本打不出来
（这点经常被拼音党拿来吐槽，不过他们忽略了现在五笔输入法大都支持“五笔拼音混输”模式，不会打五笔时可以用拼音：
虽然拼音的ushuishuishui可打出“淼”，可是也难打出这样的字啊：“薜譍”)
五笔党打出的错字往往有两类：
1) 混淆字形，比如“薛”与“薜”
2) 误输词组，比如“问题”和“总是”
第一类出错概率很小（找两个混淆的五笔单字很难 = =!）
第二类打字者自己会校验的啊！（五笔优秀的编码规则，使打词的重码率也很低）
这两类错字换到拼音打字下就惨不忍睹了 (当然，拼音中第一类是混淆读音)
“飞蝗芜湖”、“火钳刘明”等虽然看起来新潮（常见于贴吧），本质上却是拼音之过。
3. 例证
找一个五笔党的错字是很难的，找一个拼音党的错字却很容易。进贴吧看下就知道了。
目前流行的错字大都是拼音党引起的，五笔党引起的很少（虽然拼音党的人数远大于五笔党，但是按比例，拼音党的错字也太多了吧！！！而五笔党的错字几乎没有）
下面是五笔党的一个错字（欢迎找到五笔错字的同学补充！），一般人注意不到：
4. 对拼音党的吐槽
五笔党大都会拼音，而拼音党通常不会五笔。这就决定了很多拼音党不能客观地看待五笔，他们常偏颇地评价五笔。（在你不懂一个东西的时候去驳斥它，是很荒谬的；在你了解以后再去驳斥它，才有说服力）
最典型的是吴军：(他将五笔党称为输入法的表演者，可谓贻笑大方)
5. 驳斥下
的回答，为五笔正名 (为了不跑题，只说准确率)
1) "五笔不容易打错字，那是和拼音也输入单字做比较"
——五笔打词组时也不容易打错。
以中文句子"五笔不容易打错字，那是和拼音也输入单字做比较"为例，
五笔的全部输入码是（算上空格）：
“ggtt i pwjq rs qaj pb , vfb j t ruuj bn lwty ujfj pb wdt xxlu”
“ggtt”输入后得到的是“五笔”、“开玩笑”、“来来往往”
“pwjq”=“容易”
"ruuj"=“拼音”
“lwty”=“输入”、“畭”
"xxlu"="比较"
五个词组中，打“五笔”、“输入”两词时有重码，但它们都是排在首位的，想打错很难
因此，五笔不只打单字不易错，打词组也不易错啊
拼音党以整句输入为优点，在我看来这恰恰是容易导致错字的一点。拼音党输完“wubiburongyidacuozi ”以后，必须花时间校验一下，否则可能引入“无比”、“务必"这样的错字
双拼党遇到的也是同样问题（这是音码输入重码率高决定的，无论全拼、简拼、双拼）
2) “五笔没法智能，又不能自动组词什么的，丰富的词库更谈不上，因为五笔用来打词的话重码就会开始增加，所以一般五笔都是打字的”
——五笔可以智能，也能自动组词，并可以用丰富的词库，重码率远低于同规模大小的拼音词典，除非追求极致，否则五笔大都是打词的。