保罗的书信有两类，一类是写个教会的，称为教会书信；一类是写给他牧养对象的，比如写给提摩太、提多的，称为教牧书信。
“保罗来到特庇，又到路司得。在那里有一个门徒，名叫提摩太，是信主之犹太妇人的儿子，他父亲却是希腊人。路司得和以哥念的弟兄都称赞他。保罗要带他同去，只因那些地方的犹太人都知道他父亲是希腊人，就给他行了割礼。(《使徒行传》 16:1-3 )《使徒行传》里这样记载的。保罗离开以弗所的时候，将提摩太留在那里，让他管理以弗所教会的日常事务。保罗写下这封书信给提摩太正是指导他如何管理教会事务，给后世牧者带领教会提供了很好的参照。
首先，保罗提出总的原则：“但命令的总归就是爱，这爱是从清洁的心和无亏的良心、无伪的信心生出来的。”（《提摩太前书》1:5）这既是对提摩太的要求，也是告知提摩太，教会要从这个总的原则下去治理与牧养。
这时在以弗所教会里，有几个人混进来，又将犹太教里的律法和割礼等带进来，保罗让提摩太严肃处理这类混淆纯正福音的人。发现类似的情况，一直是历世历代教会要面对的问题，总有一些人要将人的道理掺杂进纯正的福音里，混淆主耶稣的道。
此外，保罗提醒提摩太，要常常保持祷告，祷告就是在做属灵争战，祷告使我们可以敬虔、端正、平安无事地度日。保罗嘱咐到：“我愿男人无忿怒，无争论（或译：疑惑），举起圣洁的手，随处祷告；又愿女人廉耻、自守，以正派衣裳为妆饰，不以编发、黄金、珍珠，和贵价的衣裳为妆饰，只要有善行，这才与自称是敬 神的女人相宜。女人要沉静学到，一味地顺服。”(《提摩太前书》 2:8-11)告诉提摩太这是让教会圣洁的一个原则，就是男人要成为祷告的男人，负有守护的责任，女人要成为真正有信靠顺服的女人。如此，教会在真道上合一，没有争辩，没有是非。如此，才能抵挡撒旦的诡计。
进入第三章，保罗谈论到教会的组织结构，是关于在教会做“监督”做“执事”的资格，无论做监督还是做执事，其实都不在乎外在的，而在乎有内在的生命，有内在的生命流淌出来，自然就能带领教会成为敬虔的教会。
正如主耶稣当年教导门徒们的，在教会一定是有稗子的，保罗也叮嘱提摩太，教会一定是有人会离弃真道的，不要以为奇怪。而他需要做的就是提醒教会的弟兄姊妹们，自己努力做好基督教会的执事就好，如何做好教会的执事？需要在敬虔上操练自己，保罗说：“只是要弃绝那世俗的言语和老妇荒渺的话，在敬虔上操练自己。操练身体，益处还少；惟独敬虔，凡事都有益处，因有今生和来生的应许。”(《提摩太前书》 4:7-8 )保罗在这里，揭示了在基督里的一个奥秘，就是敬虔让凡事都有益处，提醒我们常常操练敬虔，稗子的存在也是为了操练麦子的敬虔，万事互相效力，让敬虔的人受益。所以，保罗勉励提摩太：“你要谨慎自己和自己的教训，要在这些事上恒心；因为这样行，又能救自己，又能救听你的人。”(《提摩太前书》 4:16 )讲道不仅仅是讲给他人听的，很多时候讲给自己听的，这就是在服侍中成长的缘故。
第五章，保罗教导提摩太面对教会具体事务如何去处理，对待老年人的态度，对待寡妇的问题，对待长老的问题，对待仆人与主人的问题。在这些教导中，保罗既给出了具体做法，用智慧在爱里，持守圣洁公义的原则，柔和谦卑来处理。
最后章节，保罗再次回到关于敬虔的主题，提醒提摩太警惕金钱的诱惑，“贪财是万恶之根，有人贪恋钱财，就被引诱离了真道，用许多愁苦把自己刺透了。”（《提摩太前书》6:10）勉励提摩太要“敬虔加上知足的心便是大利了。”（《提摩太前书》6:6）。确实，无论是在教会还是在社会，人很容易被金钱掳掠，成为金钱的奴隶。
在末尾，使徒保罗语重心长写到：“提摩太啊，你要保守所托付你的，躲避世俗的虚谈和那敌真道、似是而非的学问。已经有人自称有这学问，就偏离了真道。”（《提摩太前书》6:20-21）我们看见，保罗在整个书信里面，一直在反复叮嘱提摩太，其实是圣灵在反复叮嘱我们，要保守自己在主耶稣的真道里，远避一切虚假、玄妙、空谈，唯有他的话是脚前的灯，路上的光，让我们行在主耶稣的话里。