一、指代不同
1、能动英语：以权威的专利技术，系统完善的课程体系、科学先进的教育理念，和标准化的经营管理模式，是不同于目前大众英语培训的少儿英语培训品牌。
2、自然拼读法：不仅是以英语为母语国家的孩子学习英语读音与拼字，增进阅读能力与理解力的教学法，更是以英语为第二语言的英语初学者学习发音规则与拼读技巧的教学方法。
二、方式不同
1、能动英语：可以使学习者，不读字母，不用音标；见词能读，提笔能写，张口能说，听词能懂；在阅读中积累英语知识，并以此为基础，全面发展听、说、读、写能力。
2、自然拼读法：是目前国际主流的英语教学法，它不仅是以英语为母语国家的孩子学习英语读音与拼字，增进阅读能力与理解力的教学法，更是以英语为第二语言的英语初学者学习发音规则与拼读技巧的教学方法。
三、特点不同
1、能动英语：是国内唯一具备核心专利技术，完全遵循英语语言内在规律，是真正授之以渔的系统化、标准化英语教育产品和教学体系。
2、自然拼读法：通过直接学习26个字母及字母组合在单词中的发音规则，建立字母及字母组合与发音的感知，让学生在轻松愉快的氛围中，了解和学习英语字母组合的奥妙，掌握英语拼读规律，从而达到看到单词就会读，听到单词就会拼的学习目的。
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百度百科-自然拼读法