三令五申的故事如下：
孙武流寓于吴，吴王想试试孙武的军事才能，就将180名年轻宫女交给孙武操练。孙武将宫女分作两队，让吴王的宠姬当队长。孙武向宫女们交代了口令之后击鼓传令，宫女们一阵哄笑，队伍乱成一片。孙武再一次下达命令，宫女们只觉得好玩，根本不听命令。
孙武说号令既然已经明白又不听令，这是头领之罪，下令将两名队长处死。吴王急忙叫人传令不能斩杀王妃，孙武仍然杀了两个王妃。然后，孙武重新操练宫女，这回没人敢不听号令了。
三令五申（拼音：sān lìng wǔ shēn）是一个汉语成语，最早出自西汉·司马迁《史记·孙子吴起列传》。
三令五申的意思
“三令五申”是我国古代军事纪律的简称，它最早出自《史记·孙子吴起列传》。拼音是sān lìng wǔ shēn。多指上级对下级，领导对群众。而所谓“三令”，一令观敌之谋，视道路之便，知生死之地，二令听金鼓，视旌旗，以齐其耳目，三令举斧，以宣其刑赏。
所谓“五申”：一申赏罚，以一其心，二申视分合，以一其途，三申画战阵旌旗，四申夜战听火鼓，五申听令不恭，视之以斧。“三令”与“五申”的原意是教育将士应该在点阵中或军事行动中明确作战守则。