主语一般是名词，代词，以及短语所形成的表示一个句子的状语，宾语，定语修饰的成分，主题就不一样了，他是一句话说话的重点，不一定要是主语，其他词也不一定修饰他。
举例来说吧。わたしは寿司が好きです。这里面わたし就是主语，这与汉语是一样的，而说寿司が好きです的时候，主语仍然是わたし，这时主语省略了，但还是有主语。而如果说寿司は好きですか、这时寿司是作为主题来使用的，必须用wa，而不用ga。
仔细体会一下，前一句是我喜欢寿司，描述的是一种状态，并没有任何的突出，而后一句，你喜欢寿司么，寿司此时变成了主题，整个句子以寿司为中心，目的是要询问喜欢寿司么，突出的重点在寿司，所以是主题。这时的主语是你而不是寿司。
再比如：わたしは日本人です很显然描述的是一种状态，没有突出。
日本には、日本では在日本，就有一种对比突出的意味，把在日本作为突出对象
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