in his hand与with his hand区别在于意思不同，成分不同、在句子里面有不同的搭配。
1. in his hand：在他的手中。
在句子里面可以作地点状语、表语、宾语补足语等。hand后面不能接宾语补足语。
例如：
Mr.?Green?holds?two?books?in his hand.?
格林先生手里拿着两本书。
Our?math?teacher?came?in?with?a?book?in?his hand.?
我们的数学老师拿着一本书进来了。
He?twirled?his?hat?in his hand.?
他快速旋转着手里的帽子。
He?stood?jiggling?his?car?keys?in?his hand.?
他站在那儿手里摆弄着汽车钥匙。
2. with his hand：用手。
在句子里面可以作方式状语；hand后面可以接宾语补足语。
例如：
He?rubbed?his?chin?with his?hand.?
他用手摩挲着下巴。
He?came?forward with his hand out.
他伸着手走上前来。
Tom?looked up?at?him?and?patted?the couch?with?his hand.?
汤姆抬头看着他，用手拍拍沙发。
A?strange,?sad?man?is?he,?with?his?hand?always?over his?heart!?
他真是个又奇怪又伤心的人，总是用手捂着心口！